岳陽市農業科學研究院是根據《岳陽市承擔行政職能事業單位改革試點方案的實施意見》（岳編發〔2017〕9號）文件精神，將原市畜牧科學研究所、市水產科學研究所、市蔬菜科學研究所、加掛在市農業機械推廣站的市農業機械化研究所整體并入市農業科學研究所，并更名而成，為副處級公益一類事業單位，隸屬于岳陽市農業農村局。
